菌群宿主共代谢
肠道菌群是哺乳动物体内重要的代谢“器官”,影响着宿主的整体代谢,宿主代谢受自身基因和肠道菌群基因的双重影响,宿主和菌群之间有着“共代谢”的过程。我们对尿液或粪便中的宿主-共生肠道菌群代谢物进行检测,包括苯丙氨酸代谢、脂肪酸代谢、糖代谢、嘌呤嘧啶代谢等。根据物质的化学结构类型进行分类,主要为苯类、吲哚类、碳水化合物类、氨基酸类、脂肪酸等。
测序平台与策略
液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)
技术路线
生物信息分析流程及部分结果展示
生物信息分析流程图
代谢物分类饼图 | 差异代谢物相关性热图 | 差异代谢物层次聚类分析 |
差异代谢物富集代谢通路气泡图 | 正交偏最小二乘法判别分析 | 差异代谢物火山图 |
应用领域
医学领域:用代谢组学方法来研究肠道菌群和宿主之间关联的复杂代谢体系,作为一种相对全面、连续动态且无刺激的分析手段,它可客观地检测肠道微生物的代谢组分及浓度变化,展示肠道菌群的代谢状态,挖掘代谢物的改变为疾病发生、发展及预后等机制研究提供重要信息。
畜牧业领域:通过代谢组学研究动物和肠道菌群之间的代谢体系,可阐明营养供给量、饲养条件和方式、不同饲料、兽药等引起动物体内代谢的变化特征,揭示其在动物体内作用的机制,有助于提高养殖业的生产效率,保障畜牧业安全稳定发展。主要应用于:科学饲养、疾病防治、发育研究等。